Docker版Rstudio server-ubuntu服务器

1. 安装 Docker 和 Docker Compose

使用 R 和 Docker 进行可重复性研究和独立开发环境的原因主要涉及四个关键点：透明度、可移植性、可扩展性和可重用性。此外，无论身在何处，都能在浏览器中访问 RStudio Server。

可以参考这篇 HomeLab 3 博客文章中提供的详细步骤。

sudo apt update  
sudo apt upgrade

mkdir -p $HOME/docker/rstudio && cd $HOME/docker/rstudio

# 查看rstudio的镜像,选star最多的那个官方的
docker search rstudio
docker pull rocker/rstudio:latest

2. 启动 RStudio Server 容器

为卷/绑定挂载创建目录

# 为卷/绑定挂载创建文件夹，在rstudio目录下：
mkdir renv  
mkdir r-projects  
mkdir r-scripts  
mkdir shiny-apps

创建docker-compose.yaml文件：

touch docker-compose.yaml
vim docker-compose.yaml

复制以下文本：

version: "3.6"

services:

  rstudio:
    image: rocker/verse:latest
    container_name: rstudio
    restart: unless-stopped
    #env_file: .rstudio.env # 如果需要，可以在这里声明密码
    ports:
      - 8787:8787
    environment:
      - PASSWORD=password
    volumes:
      - type: volume
        source:  rstudio
        target: $HOME/docker/rstudio
      - type: bind
        source: ./r-projects
        target: $HOME/docker/rstudio/r-projects
      - type: bind
        source: ./r-scripts
        target: $HOME/docker/rstudio/r-scripts
      - type: bind
        source: ./renv
        target: $HOME/docker/rstudio/renv
      - type: bind
        source: ./shiny-apps
        target: $HOME/docker/rstudio/shiny-apps
      - type: volume
        source: r_libs
        target: /usr/local/lib/R

volumes: 
  r_libs: 
  rstudio: 

特别注意：
docker-compose.yaml文件，每个冒号后面需要有空格，每个-线后有空格，包括：- 8787:8787,- PASSWORD=C11223344g, - type: bind

防火墙开放8787端口

sudo ufw allow 8787

启动容器：

sudo docker-compose up -d

若遇到问题，重新启动rstudio server容器的方法

1.进入本docker-compose.yaml的目录

cd $HOME/docker/rstudio

2.运行docker-compose命令

sudo docker-compose up -d